Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.42
APLP2Q06481 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
APLP2Q06481 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
APLP2Q06481 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
APLP2Q06481 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
APLP2Q06481 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
APLP2Q06481 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
APLP2Q06481 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
APLP2Q06481 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms