Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSBP1Q04837 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms