Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 TAF11YML015C 1041 nt5.1□□□□□ -1.59
CCE1Q03702 DFG5YMR238W 1377 nt5.1□□□□□ -1.59
CCE1Q03702 YNL194CYNL194C 906 nt5.1□□□□□ -1.59
CCE1Q03702 YIR007WYIR007W 2295 nt5.09□□□□□ -1.59
CCE1Q03702 SIR2YDL042C 1689 nt5.09□□□□□ -1.59
CCE1Q03702 PDH1YPR002W 1551 nt5.09□□□□□ -1.59
CCE1Q03702 HOS1YPR068C 1413 nt5.09□□□□□ -1.59
CCE1Q03702 SFB3YHR098C 2790 nt5.09□□□□□ -1.59
CCE1Q03702 PIF1YML061C 2580 nt5.09□□□□□ -1.59
CCE1Q03702 EAF5YEL018W 840 nt5.09□□□□□ -1.59
CCE1Q03702 SOH1YGL127C 384 nt5.09□□□□□ -1.59
CCE1Q03702 SIT1YEL065W 1887 nt5.09□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 BRF1YGR246C 1791 nt5.09□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 CST6YIL036W 1764 nt5.09□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 VBA1YMR088C 1689 nt5.08□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 GUS1YGL245W 2127 nt5.08□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 BBP1YPL255W 1158 nt5.08□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 HXT3YDR345C 1704 nt5.08□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 SSZ1YHR064C 1617 nt5.08□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 CLP1YOR250C 1338 nt5.07□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 UTP9YHR196W 1728 nt5.07□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 SCO1YBR037C 888 nt5.07□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 MRL1YPR079W 1146 nt5.07□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 DCC1YCL016C 1143 nt5.07□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 HPF1YOL155C 2904 nt5.07□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 AVT3YKL146W 2079 nt5.07□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 MKK2YPL140C 1521 nt5.07□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 MPM1YJL066C 759 nt5.06□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 ODC2YOR222W 924 nt5.06□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 HAL1YPR005C 885 nt5.06□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 MCM6YGL201C 3054 nt5.06□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 CCZ1YBR131W 2115 nt5.06□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 HFI1YPL254W 1467 nt5.06□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 UTR4YEL038W 684 nt5.05□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 ADK2YER170W 678 nt5.05□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 SUA5YGL169W 1281 nt5.05□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 MND2YIR025W 1107 nt5.05□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 RPA49YNL248C 1248 nt5.05□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 RCK1YGL158W 1539 nt5.05□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 NQM1YGR043C 1002 nt5.04□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 POR1YNL055C 852 nt5.04□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 GAL10YBR019C 2100 nt5.04□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 RDL1YOR285W 420 nt5.04□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 YPL062WYPL062W 405 nt5.04□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 DNF2YDR093W 4839 nt5.04□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 YFL034WYFL034W 3222 nt5.04□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 APJ1YNL077W 1587 nt5.04□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 VPS1YKR001C 2115 nt5.03□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 ROG3YFR022W 2202 nt5.03□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 GCS1YDL226C 1059 nt5.03□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 ERD1YDR414C 1089 nt5.03□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.03□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 ELC1YPL046C 300 nt5.03□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 SSK22YCR073C 3996 nt5.03□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 HOS2YGL194C 1359 nt5.03□□□□□ -1.6
CCE1Q03702 ECM7YLR443W 1347 nt5.02□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 BSC5YNR069C 1470 nt5.02□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 CWC21YDR482C 408 nt5.02□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 PRE7YBL041W 726 nt5.02□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 YNL108CYNL108C 813 nt5.02□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 REG2YBR050C 1017 nt5.02□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 STE50YCL032W 1041 nt5.02□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 MAL11YGR289C 1851 nt5.02□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 YIL067CYIL067C 2037 nt5.02□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 RGT1YKL038W 3513 nt5.01□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 BUD28YLR062C 378 nt5.01□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 YNL228WYNL228W 777 nt5.01□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 CKB2YOR039W 777 nt5.01□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 TNA1YGR260W 1605 nt5.01□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 ATG20YDL113C 1923 nt5□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 VCX1YDL128W 1236 nt5□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 YDR396WYDR396W 501 nt5□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 VAM7YGL212W 951 nt5□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 RHO3YIL118W 696 nt5□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 YMR147WYMR147W 672 nt5□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 SER1YOR184W 1188 nt5□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 VAN1YML115C 1608 nt5□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 FET3YMR058W 1911 nt4.99□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 VMA13YPR036W 1437 nt4.99□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 RAD53YPL153C 2466 nt4.99□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 IWR1YDL115C 1062 nt4.99□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 YDR134CYDR134C 411 nt4.99□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 PEX7YDR142C 1128 nt4.99□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 NAG1YGR031C-A 492 nt4.99□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.99□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 YML131WYML131W 1098 nt4.99□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 PTR2YKR093W 1806 nt4.99□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt4.98□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 EPS1YIL005W 2106 nt4.98□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 COX17YLL009C 210 nt4.98□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 YOR024WYOR024W 324 nt4.98□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 PDB1YBR221C 1101 nt4.98□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 CLB4YLR210W 1383 nt4.98□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 RPT4YOR259C 1314 nt4.97□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 TUL1YKL034W 2277 nt4.97□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt4.97□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 CWC25YNL245C 540 nt4.97□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 CPA1YOR303W 1236 nt4.97□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 TOM5YPR133W-A 153 nt4.97□□□□□ -1.61
CCE1Q03702 GSY2YLR258W 2118 nt4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms