Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAX5Q02548 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX5Q02548 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms