Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BDH1Q02338 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BDH1Q02338 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms