Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAP1Q01518 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAP1Q01518 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAP1Q01518 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAP1Q01518 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAP1Q01518 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAP1Q01518 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAP1Q01518 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAP1Q01518 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAP1Q01518 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAP1Q01518 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms