Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYBPC1Q00872 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYBPC1Q00872 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYBPC1Q00872 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYBPC1Q00872 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYBPC1Q00872 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYBPC1Q00872 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYBPC1Q00872 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYBPC1Q00872 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms