Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDPQ00604 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDPQ00604 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDPQ00604 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDPQ00604 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NDPQ00604 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NDPQ00604 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDPQ00604 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDPQ00604 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDPQ00604 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDPQ00604 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDPQ00604 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDPQ00604 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDPQ00604 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDPQ00604 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDPQ00604 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDPQ00604 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDPQ00604 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NDPQ00604 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDPQ00604 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NDPQ00604 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDPQ00604 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NDPQ00604 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDPQ00604 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NDPQ00604 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDPQ00604 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDPQ00604 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDPQ00604 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDPQ00604 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDPQ00604 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NDPQ00604 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDPQ00604 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDPQ00604 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDPQ00604 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDPQ00604 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDPQ00604 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDPQ00604 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDPQ00604 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDPQ00604 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDPQ00604 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDPQ00604 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDPQ00604 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDPQ00604 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDPQ00604 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDPQ00604 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDPQ00604 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDPQ00604 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDPQ00604 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDPQ00604 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDPQ00604 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDPQ00604 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDPQ00604 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDPQ00604 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDPQ00604 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDPQ00604 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDPQ00604 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDPQ00604 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDPQ00604 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDPQ00604 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDPQ00604 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDPQ00604 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDPQ00604 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDPQ00604 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDPQ00604 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDPQ00604 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDPQ00604 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDPQ00604 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDPQ00604 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDPQ00604 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDPQ00604 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDPQ00604 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDPQ00604 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NDPQ00604 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDPQ00604 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDPQ00604 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDPQ00604 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDPQ00604 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDPQ00604 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NDPQ00604 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDPQ00604 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDPQ00604 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDPQ00604 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDPQ00604 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms