Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4BP68371 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms