Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSNL1P62760 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VSNL1P62760 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms