Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPFP62306 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms