Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP46P62068 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP46P62068 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP46P62068 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP46P62068 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP46P62068 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP46P62068 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP46P62068 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP46P62068 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP46P62068 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP46P62068 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP46P62068 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP46P62068 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP46P62068 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP46P62068 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP46P62068 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP46P62068 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP46P62068 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP46P62068 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP46P62068 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP46P62068 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP46P62068 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP46P62068 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP46P62068 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP46P62068 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP46P62068 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP46P62068 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP46P62068 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP46P62068 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP46P62068 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP46P62068 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP46P62068 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP46P62068 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP46P62068 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP46P62068 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP46P62068 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP46P62068 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP46P62068 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP46P62068 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP46P62068 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP46P62068 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP46P62068 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP46P62068 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP46P62068 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP46P62068 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP46P62068 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP46P62068 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP46P62068 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP46P62068 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP46P62068 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP46P62068 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP46P62068 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP46P62068 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP46P62068 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP46P62068 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP46P62068 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP46P62068 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP46P62068 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP46P62068 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP46P62068 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP46P62068 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP46P62068 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP46P62068 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP46P62068 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP46P62068 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP46P62068 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP46P62068 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP46P62068 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP46P62068 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP46P62068 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP46P62068 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP46P62068 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP46P62068 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP46P62068 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP46P62068 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP46P62068 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP46P62068 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP46P62068 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP46P62068 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP46P62068 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP46P62068 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP46P62068 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP46P62068 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP46P62068 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP46P62068 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP46P62068 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP46P62068 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP46P62068 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP46P62068 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms