Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1BP61266 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1BP61266 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1BP61266 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1BP61266 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1BP61266 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1BP61266 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1BP61266 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1BP61266 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1BP61266 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1BP61266 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1BP61266 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1BP61266 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1BP61266 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1BP61266 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1BP61266 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1BP61266 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1BP61266 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX1BP61266 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1BP61266 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1BP61266 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1BP61266 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1BP61266 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1BP61266 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX1BP61266 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1BP61266 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1BP61266 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1BP61266 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1BP61266 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1BP61266 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1BP61266 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX1BP61266 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX1BP61266 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX1BP61266 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX1BP61266 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX1BP61266 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX1BP61266 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX1BP61266 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX1BP61266 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1BP61266 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1BP61266 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1BP61266 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1BP61266 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1BP61266 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1BP61266 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1BP61266 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1BP61266 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1BP61266 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1BP61266 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX1BP61266 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX1BP61266 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1BP61266 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1BP61266 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1BP61266 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1BP61266 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1BP61266 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1BP61266 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1BP61266 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1BP61266 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1BP61266 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1BP61266 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX1BP61266 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX1BP61266 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms