Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF10P55107 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF10P55107 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF10P55107 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF10P55107 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF10P55107 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF10P55107 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF10P55107 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF10P55107 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF10P55107 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF10P55107 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF10P55107 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF10P55107 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF10P55107 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF10P55107 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF10P55107 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF10P55107 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GDF10P55107 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GDF10P55107 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF10P55107 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF10P55107 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF10P55107 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF10P55107 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF10P55107 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF10P55107 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF10P55107 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF10P55107 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF10P55107 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF10P55107 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF10P55107 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF10P55107 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF10P55107 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF10P55107 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF10P55107 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF10P55107 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF10P55107 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF10P55107 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF10P55107 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF10P55107 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF10P55107 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF10P55107 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF10P55107 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF10P55107 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF10P55107 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF10P55107 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF10P55107 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF10P55107 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF10P55107 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF10P55107 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF10P55107 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF10P55107 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF10P55107 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF10P55107 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF10P55107 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF10P55107 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF10P55107 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF10P55107 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF10P55107 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF10P55107 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF10P55107 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF10P55107 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF10P55107 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF10P55107 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF10P55107 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF10P55107 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF10P55107 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF10P55107 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF10P55107 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF10P55107 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF10P55107 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF10P55107 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF10P55107 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF10P55107 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF10P55107 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms