Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 MPC1YGL080W 393 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 RRP4YHR069C 1080 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 POR2YIL114C 846 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 ADD66YKL206C 804 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 YKL223WYKL223W 333 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 YLR346CYLR346C 306 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 PSH1YOL054W 1221 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 HEM15YOR176W 1182 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 RBD2YPL246C 789 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 MLC2YPR188C 492 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 RRT2YBR246W 1164 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 RKM4YDR257C 1485 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 TRP3YKL211C 1455 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 GYP1YOR070C 1914 nt5.68□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 ADK2YER170W 678 nt5.68□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 EDC1YGL222C 528 nt5.68□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 FES1YBR101C 873 nt5.68□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 snR34snR34 203 nt5.68□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 RIM101YHL027W 1878 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 PEX19YDL065C 1029 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 SNF11YDR073W 510 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 ATO3YDR384C 828 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 CAB4YGR277C 918 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 HCR1YLR192C 798 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 YET2YMR040W 483 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 ELC1YPL046C 300 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 ECM2YBR065C 1095 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 ECM33YBR078W 1290 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 ATG18YFR021W 1503 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 KRS1YDR037W 1776 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 CLB4YLR210W 1383 nt5.67□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 RRN3YKL125W 1884 nt5.66□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 HEM3YDL205C 984 nt5.66□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 SKI6YGR195W 741 nt5.66□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 MPC54YOR177C 1395 nt5.66□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 UGX2YDL169C 672 nt5.65□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 RSM10YDR041W 612 nt5.65□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 DFM1YDR411C 1026 nt5.65□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 YGR066CYGR066C 879 nt5.65□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 SPO12YHR152W 522 nt5.65□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 RHO2YNL090W 579 nt5.65□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 POS5YPL188W 1245 nt5.65□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 TEF1YPR080W 1377 nt5.65□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 TEF2YBR118W 1377 nt5.65□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 SNT2YGL131C 4212 nt5.64□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 QDR3YBR043C 2070 nt5.64□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 MNS1YJR131W 1650 nt5.64□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 SIT4YDL047W 936 nt5.64□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 YIR043CYIR043C 693 nt5.64□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 HOR7YMR251W-A 180 nt5.64□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 RPS9AYPL081W 594 nt5.64□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 FZO1YBR179C 2568 nt5.63□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 PXA1YPL147W 2613 nt5.63□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 MSA2YKR077W 1092 nt5.63□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 YLR296WYLR296W 327 nt5.63□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 ECM19YLR390W 339 nt5.63□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 PRP46YPL151C 1356 nt5.63□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 YPL245WYPL245W 1365 nt5.63□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 ADE3YGR204W 2841 nt5.63□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 MRK1YDL079C 1506 nt5.63□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.62□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 PCL6YER059W 1263 nt5.62□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 CAX4YGR036C 720 nt5.62□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 YGR122WYGR122W 1209 nt5.62□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 PGA2YNL149C 390 nt5.62□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 HAL1YPR005C 885 nt5.62□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 TIP41YPR040W 1071 nt5.62□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 ARR1YPR199C 885 nt5.62□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 ATG12YBR217W 561 nt5.62□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 GAL4YPL248C 2646 nt5.62□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 SAS4YDR181C 1446 nt5.62□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 SRG1SRG1 551 nt5.61□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 ASP1YDR321W 1146 nt5.61□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 RCK1YGL158W 1539 nt5.61□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 YHR095WYHR095W 495 nt5.61□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 YLR126CYLR126C 756 nt5.61□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 ZRT2YLR130C 1269 nt5.61□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 MID2YLR332W 1131 nt5.61□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 HPF1YOL155C 2904 nt5.61□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 FUM1YPL262W 1467 nt5.61□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 ARH1YDR376W 1482 nt5.6□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 YJR124CYJR124C 1347 nt5.6□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 IMG2YCR071C 441 nt5.6□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 YIL060WYIL060W 435 nt5.6□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 YNL228WYNL228W 777 nt5.6□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 RFT1YBL020W 1725 nt5.6□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 FPK1YNR047W 2682 nt5.59□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 snR57snR57 88 nt5.59□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 SPC42YKL042W 1092 nt5.59□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 UTP18YJL069C 1785 nt5.59□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 ASH1YKL185W 1767 nt5.59□□□□□ -1.51
YNL058CP53947 VTC2YFL004W 2487 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 HER2YMR293C 1395 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 BAP2YBR068C 1830 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 PMT2YAL023C 2280 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 MNN2YBR015C 1794 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 YCL065WYCL065W 369 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 MTQ2YDR140W 666 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 DBP8YHR169W 1296 nt5.58□□□□□ -1.52
YNL058CP53947 ECM1YAL059W 639 nt5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 81.8 ms