Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP98P52948 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP98P52948 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP98P52948 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP98P52948 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP98P52948 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP98P52948 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP98P52948 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP98P52948 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP98P52948 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP98P52948 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NUP98P52948 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP98P52948 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP98P52948 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP98P52948 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP98P52948 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP98P52948 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP98P52948 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP98P52948 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP98P52948 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP98P52948 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP98P52948 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP98P52948 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP98P52948 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP98P52948 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP98P52948 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP98P52948 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP98P52948 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP98P52948 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP98P52948 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP98P52948 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP98P52948 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP98P52948 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP98P52948 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP98P52948 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP98P52948 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP98P52948 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP98P52948 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP98P52948 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP98P52948 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP98P52948 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP98P52948 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP98P52948 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP98P52948 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP98P52948 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP98P52948 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP98P52948 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP98P52948 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP98P52948 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP98P52948 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP98P52948 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP98P52948 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP98P52948 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP98P52948 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP98P52948 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP98P52948 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP98P52948 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP98P52948 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP98P52948 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP98P52948 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP98P52948 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP98P52948 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP98P52948 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP98P52948 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP98P52948 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP98P52948 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP98P52948 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP98P52948 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP98P52948 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP98P52948 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP98P52948 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP98P52948 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP98P52948 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP98P52948 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP98P52948 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP98P52948 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP98P52948 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP98P52948 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP98P52948 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP98P52948 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP98P52948 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP98P52948 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP98P52948 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP98P52948 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP98P52948 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP98P52948 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP98P52948 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP98P52948 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP98P52948 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms