Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR5P51681 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR5P51681 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR5P51681 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR5P51681 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR5P51681 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR5P51681 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR5P51681 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR5P51681 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR5P51681 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR5P51681 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR5P51681 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR5P51681 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR5P51681 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR5P51681 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCR5P51681 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCR5P51681 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR5P51681 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR5P51681 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR5P51681 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR5P51681 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR5P51681 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR5P51681 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR5P51681 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR5P51681 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR5P51681 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR5P51681 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR5P51681 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR5P51681 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR5P51681 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR5P51681 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR5P51681 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR5P51681 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR5P51681 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR5P51681 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR5P51681 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR5P51681 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR5P51681 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR5P51681 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR5P51681 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR5P51681 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR5P51681 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR5P51681 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR5P51681 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR5P51681 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR5P51681 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR5P51681 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR5P51681 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR5P51681 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR5P51681 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR5P51681 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR5P51681 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR5P51681 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR5P51681 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR5P51681 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR5P51681 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR5P51681 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR5P51681 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR5P51681 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR5P51681 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR5P51681 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR5P51681 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR5P51681 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR5P51681 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR5P51681 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR5P51681 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCR5P51681 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCR5P51681 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR5P51681 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR5P51681 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR5P51681 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR5P51681 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR5P51681 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR5P51681 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR5P51681 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR5P51681 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR5P51681 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR5P51681 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR5P51681 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR5P51681 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR5P51681 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR5P51681 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR5P51681 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR5P51681 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR5P51681 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR5P51681 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR5P51681 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR5P51681 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR5P51681 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR5P51681 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR5P51681 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR5P51681 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR5P51681 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR5P51681 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR5P51681 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR5P51681 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR5P51681 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR5P51681 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR5P51681 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR5P51681 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms