Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC42.39■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC42.39■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
SMARCA4P51532 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC42.32■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SMARCA4P51532 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
SMARCA4P51532 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SMARCA4P51532 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SMARCA4P51532 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms