Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB27AP51159 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB27AP51159 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms