Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP1P50238 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms