Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIG4P49917 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIG4P49917 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIG4P49917 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG4P49917 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG4P49917 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG4P49917 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG4P49917 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG4P49917 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG4P49917 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG4P49917 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG4P49917 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG4P49917 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG4P49917 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG4P49917 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG4P49917 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG4P49917 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG4P49917 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG4P49917 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG4P49917 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG4P49917 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG4P49917 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG4P49917 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG4P49917 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG4P49917 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG4P49917 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG4P49917 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG4P49917 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG4P49917 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG4P49917 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG4P49917 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG4P49917 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG4P49917 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG4P49917 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG4P49917 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG4P49917 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG4P49917 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG4P49917 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG4P49917 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG4P49917 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG4P49917 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG4P49917 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG4P49917 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG4P49917 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG4P49917 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIG4P49917 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIG4P49917 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIG4P49917 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIG4P49917 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIG4P49917 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIG4P49917 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG4P49917 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG4P49917 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG4P49917 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG4P49917 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG4P49917 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG4P49917 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG4P49917 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG4P49917 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG4P49917 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG4P49917 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG4P49917 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG4P49917 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG4P49917 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG4P49917 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG4P49917 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG4P49917 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG4P49917 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG4P49917 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG4P49917 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG4P49917 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG4P49917 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG4P49917 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG4P49917 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG4P49917 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG4P49917 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG4P49917 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG4P49917 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG4P49917 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG4P49917 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG4P49917 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG4P49917 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG4P49917 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG4P49917 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG4P49917 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG4P49917 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG4P49917 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG4P49917 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG4P49917 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG4P49917 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG4P49917 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG4P49917 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG4P49917 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG4P49917 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG4P49917 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG4P49917 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG4P49917 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG4P49917 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG4P49917 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG4P49917 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms