Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSEN2P49810 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN2P49810 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms