Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARS2P49590 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARS2P49590 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HARS2P49590 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARS2P49590 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARS2P49590 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARS2P49590 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARS2P49590 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARS2P49590 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HARS2P49590 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARS2P49590 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARS2P49590 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARS2P49590 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARS2P49590 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARS2P49590 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARS2P49590 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARS2P49590 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARS2P49590 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARS2P49590 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARS2P49590 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARS2P49590 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HARS2P49590 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARS2P49590 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARS2P49590 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARS2P49590 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARS2P49590 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARS2P49590 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARS2P49590 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARS2P49590 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARS2P49590 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARS2P49590 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARS2P49590 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HARS2P49590 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HARS2P49590 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HARS2P49590 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HARS2P49590 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HARS2P49590 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HARS2P49590 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HARS2P49590 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HARS2P49590 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HARS2P49590 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HARS2P49590 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HARS2P49590 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HARS2P49590 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HARS2P49590 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HARS2P49590 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARS2P49590 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARS2P49590 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARS2P49590 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARS2P49590 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARS2P49590 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARS2P49590 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARS2P49590 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HARS2P49590 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARS2P49590 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARS2P49590 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARS2P49590 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARS2P49590 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARS2P49590 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARS2P49590 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HARS2P49590 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HARS2P49590 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HARS2P49590 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARS2P49590 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARS2P49590 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARS2P49590 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARS2P49590 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARS2P49590 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARS2P49590 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARS2P49590 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HARS2P49590 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HARS2P49590 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HARS2P49590 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HARS2P49590 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HARS2P49590 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HARS2P49590 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms