Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC11A1P49279 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC11A1P49279 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC11A1P49279 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC11A1P49279 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms