Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABIFP47224 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABIFP47224 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABIFP47224 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABIFP47224 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABIFP47224 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABIFP47224 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABIFP47224 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABIFP47224 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABIFP47224 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABIFP47224 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABIFP47224 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABIFP47224 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABIFP47224 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABIFP47224 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABIFP47224 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RABIFP47224 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABIFP47224 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABIFP47224 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABIFP47224 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABIFP47224 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RABIFP47224 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABIFP47224 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABIFP47224 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABIFP47224 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RABIFP47224 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABIFP47224 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABIFP47224 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABIFP47224 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABIFP47224 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABIFP47224 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABIFP47224 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABIFP47224 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABIFP47224 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABIFP47224 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABIFP47224 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABIFP47224 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABIFP47224 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABIFP47224 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABIFP47224 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABIFP47224 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABIFP47224 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABIFP47224 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABIFP47224 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABIFP47224 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABIFP47224 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABIFP47224 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABIFP47224 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABIFP47224 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABIFP47224 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RABIFP47224 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABIFP47224 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABIFP47224 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABIFP47224 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RABIFP47224 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABIFP47224 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABIFP47224 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABIFP47224 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABIFP47224 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABIFP47224 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABIFP47224 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABIFP47224 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RABIFP47224 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABIFP47224 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RABIFP47224 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABIFP47224 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABIFP47224 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABIFP47224 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABIFP47224 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABIFP47224 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABIFP47224 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABIFP47224 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABIFP47224 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABIFP47224 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABIFP47224 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABIFP47224 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABIFP47224 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABIFP47224 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABIFP47224 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABIFP47224 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABIFP47224 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABIFP47224 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABIFP47224 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABIFP47224 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABIFP47224 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABIFP47224 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABIFP47224 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms