Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BRCC3P46736 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRCC3P46736 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms