Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKX2-1P43699 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NKX2-1P43699 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms