Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV4P43268 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV4P43268 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV4P43268 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETV4P43268 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETV4P43268 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETV4P43268 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETV4P43268 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETV4P43268 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETV4P43268 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETV4P43268 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV4P43268 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV4P43268 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV4P43268 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV4P43268 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV4P43268 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV4P43268 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV4P43268 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV4P43268 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ETV4P43268 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ETV4P43268 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ETV4P43268 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ETV4P43268 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ETV4P43268 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ETV4P43268 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ETV4P43268 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV4P43268 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV4P43268 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV4P43268 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV4P43268 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV4P43268 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV4P43268 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV4P43268 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV4P43268 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV4P43268 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV4P43268 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV4P43268 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV4P43268 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV4P43268 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV4P43268 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV4P43268 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV4P43268 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV4P43268 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV4P43268 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV4P43268 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV4P43268 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ETV4P43268 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ETV4P43268 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ETV4P43268 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ETV4P43268 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ETV4P43268 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ETV4P43268 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ETV4P43268 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ETV4P43268 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ETV4P43268 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV4P43268 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV4P43268 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV4P43268 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV4P43268 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV4P43268 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV4P43268 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV4P43268 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV4P43268 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV4P43268 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV4P43268 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ETV4P43268 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ETV4P43268 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ETV4P43268 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ETV4P43268 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ETV4P43268 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV4P43268 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV4P43268 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV4P43268 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV4P43268 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV4P43268 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV4P43268 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV4P43268 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV4P43268 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV4P43268 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV4P43268 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV4P43268 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV4P43268 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV4P43268 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV4P43268 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV4P43268 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV4P43268 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV4P43268 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV4P43268 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ETV4P43268 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ETV4P43268 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ETV4P43268 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ETV4P43268 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ETV4P43268 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ETV4P43268 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ETV4P43268 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ETV4P43268 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ETV4P43268 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ETV4P43268 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ETV4P43268 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ETV4P43268 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms