Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A4P43007 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC1A4P43007 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms