Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A1P43005 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A1P43005 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC1A1P43005 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms