Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC1A2P43004 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A2P43004 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A2P43004 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms