Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL35P42766 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL35P42766 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL35P42766 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL35P42766 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL35P42766 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL35P42766 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL35P42766 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL35P42766 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL35P42766 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL35P42766 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL35P42766 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL35P42766 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL35P42766 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL35P42766 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL35P42766 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL35P42766 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL35P42766 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL35P42766 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL35P42766 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL35P42766 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL35P42766 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL35P42766 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL35P42766 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL35P42766 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL35P42766 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL35P42766 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL35P42766 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL35P42766 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL35P42766 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL35P42766 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL35P42766 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL35P42766 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL35P42766 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL35P42766 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL35P42766 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL35P42766 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL35P42766 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL35P42766 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL35P42766 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL35P42766 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL35P42766 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL35P42766 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL35P42766 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL35P42766 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL35P42766 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL35P42766 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL35P42766 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL35P42766 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL35P42766 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL35P42766 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms