Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX1P40424 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX1P40424 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX1P40424 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX1P40424 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX1P40424 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX1P40424 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX1P40424 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX1P40424 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX1P40424 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX1P40424 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX1P40424 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX1P40424 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX1P40424 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX1P40424 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX1P40424 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX1P40424 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX1P40424 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX1P40424 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX1P40424 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX1P40424 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX1P40424 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX1P40424 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX1P40424 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX1P40424 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX1P40424 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX1P40424 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX1P40424 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX1P40424 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX1P40424 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX1P40424 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX1P40424 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX1P40424 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX1P40424 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX1P40424 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX1P40424 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX1P40424 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX1P40424 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX1P40424 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX1P40424 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX1P40424 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX1P40424 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX1P40424 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX1P40424 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX1P40424 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX1P40424 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX1P40424 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX1P40424 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX1P40424 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX1P40424 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX1P40424 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX1P40424 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX1P40424 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX1P40424 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX1P40424 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX1P40424 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX1P40424 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX1P40424 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX1P40424 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX1P40424 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX1P40424 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX1P40424 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX1P40424 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX1P40424 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX1P40424 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX1P40424 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX1P40424 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX1P40424 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX1P40424 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX1P40424 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX1P40424 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX1P40424 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX1P40424 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX1P40424 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX1P40424 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX1P40424 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX1P40424 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX1P40424 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX1P40424 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX1P40424 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX1P40424 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX1P40424 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX1P40424 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX1P40424 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX1P40424 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX1P40424 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX1P40424 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX1P40424 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX1P40424 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX1P40424 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX1P40424 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBX1P40424 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX1P40424 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX1P40424 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX1P40424 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX1P40424 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX1P40424 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX1P40424 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBX1P40424 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBX1P40424 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms