Protein–RNA interactions for Protein: P40347

LTP1, Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LTP1P40347 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 COA1YIL157C 594 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 MTQ1YNL063W 945 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 DSC2YOL073C 969 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 PAT1YCR077C 2391 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 ARH1YDR376W 1482 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 AMD1YML035C 2433 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 UBP7YIL156W 3216 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 WHI4YDL224C 1950 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 FRS2YFL022C 1512 nt5.43□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YDL158CYDL158C 309 nt5.43□□□□□ -1.54
LTP1P40347 ATP6Q0085 780 nt5.43□□□□□ -1.54
LTP1P40347 GTO1YGR154C 1071 nt5.43□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YIR042CYIR042C 711 nt5.43□□□□□ -1.54
LTP1P40347 OMA1YKR087C 1038 nt5.43□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YMR010WYMR010W 1218 nt5.43□□□□□ -1.54
LTP1P40347 SPS18YNL204C 903 nt5.43□□□□□ -1.54
LTP1P40347 PDR16YNL231C 1056 nt5.43□□□□□ -1.54
LTP1P40347 CBP1YJL209W 1965 nt5.43□□□□□ -1.54
LTP1P40347 RTT106YNL206C 1368 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 NOB1YOR056C 1380 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 KTR5YNL029C 1569 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 TIM54YJL054W 1437 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 RPT3YDR394W 1287 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 MRPL25YGR076C 474 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YLR169WYLR169W 354 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YLR198CYLR198C 360 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 CKA2YOR061W 1020 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YPL245WYPL245W 1365 nt5.42□□□□□ -1.54
LTP1P40347 MUM3YOR298W 1440 nt5.41□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YCR006CYCR006C 474 nt5.41□□□□□ -1.54
LTP1P40347 SPC42YKL042W 1092 nt5.41□□□□□ -1.54
LTP1P40347 TFS1YLR178C 660 nt5.41□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YOL024WYOL024W 519 nt5.41□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YJR124CYJR124C 1347 nt5.41□□□□□ -1.54
LTP1P40347 HER2YMR293C 1395 nt5.41□□□□□ -1.54
LTP1P40347 FPK1YNR047W 2682 nt5.41□□□□□ -1.54
LTP1P40347 VBA1YMR088C 1689 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 RKM4YDR257C 1485 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YDR541CYDR541C 1035 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 FSH1YHR049W 732 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 OAC1YKL120W 975 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 MEU1YLR017W 1014 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 DUS4YLR405W 1104 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YNL019CYNL019C 855 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YNL033WYNL033W 855 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YPL014WYPL014W 1146 nt5.4□□□□□ -1.54
LTP1P40347 HXT5YHR096C 1779 nt5.39□□□□□ -1.55
LTP1P40347 RSP5YER125W 2430 nt5.39□□□□□ -1.55
LTP1P40347 ACS1YAL054C 2142 nt5.39□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YJR015WYJR015W 1533 nt5.39□□□□□ -1.55
LTP1P40347 VPS61YDR136C 573 nt5.39□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YGR283CYGR283C 1026 nt5.39□□□□□ -1.55
LTP1P40347 XPT1YJR133W 630 nt5.39□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt5.39□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.39□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 MHR1YDR296W 681 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 DJP1YIR004W 1299 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 APS3YJL024C 585 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YKL151CYKL151C 1014 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 ECM1YAL059W 639 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YOL035CYOL035C 303 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YOL107WYOL107W 1029 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 TEP1YNL128W 1305 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 PAF1YBR279W 1338 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 SAC6YDR129C 1929 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YHR177WYHR177W 1362 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 ARP3YJR065C 1350 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 PRP46YPL151C 1356 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YDR132CYDR132C 1488 nt5.38□□□□□ -1.55
LTP1P40347 SIS2YKR072C 1689 nt5.37□□□□□ -1.55
LTP1P40347 VHT1YGR065C 1782 nt5.37□□□□□ -1.55
LTP1P40347 AAD6YFL056C 639 nt5.37□□□□□ -1.55
LTP1P40347 VPS1YKR001C 2115 nt5.37□□□□□ -1.55
LTP1P40347 SLX1YBR228W 915 nt5.37□□□□□ -1.55
LTP1P40347 KCH1YJR054W 1494 nt5.37□□□□□ -1.55
LTP1P40347 RAP1YNL216W 2484 nt5.37□□□□□ -1.55
LTP1P40347 RAD53YPL153C 2466 nt5.37□□□□□ -1.55
LTP1P40347 CLN1YMR199W 1641 nt5.37□□□□□ -1.55
LTP1P40347 MCM3YEL032W 2916 nt5.37□□□□□ -1.55
LTP1P40347 PHO92YDR374C 921 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 BUD16YEL029C 939 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 GFD1YMR255W 567 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YNL303WYNL303W 348 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YNR040WYNR040W 771 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 OSW1YOR255W 837 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 YOR342CYOR342C 960 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 RER1YCL001W 567 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 DXO1YDR370C 1329 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 PSY4YBL046W 1326 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 GIP2YER054C 1647 nt5.36□□□□□ -1.55
LTP1P40347 GSH2YOL049W 1476 nt5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24 ms