Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTRLP40313 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTRLP40313 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTRLP40313 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTRLP40313 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTRLP40313 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTRLP40313 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTRLP40313 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTRLP40313 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTRLP40313 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTRLP40313 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTRLP40313 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTRLP40313 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTRLP40313 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTRLP40313 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTRLP40313 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTRLP40313 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTRLP40313 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTRLP40313 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTRLP40313 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTRLP40313 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTRLP40313 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTRLP40313 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTRLP40313 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTRLP40313 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTRLP40313 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTRLP40313 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTRLP40313 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTRLP40313 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTRLP40313 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTRLP40313 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTRLP40313 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTRLP40313 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTRLP40313 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTRLP40313 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTRLP40313 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTRLP40313 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTRLP40313 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTRLP40313 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTRLP40313 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTRLP40313 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTRLP40313 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTRLP40313 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTRLP40313 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTRLP40313 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTRLP40313 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTRLP40313 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTRLP40313 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTRLP40313 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTRLP40313 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTRLP40313 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTRLP40313 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTRLP40313 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTRLP40313 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTRLP40313 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTRLP40313 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTRLP40313 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTRLP40313 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTRLP40313 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTRLP40313 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTRLP40313 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTRLP40313 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTRLP40313 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTRLP40313 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTRLP40313 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms