Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPGP40121 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPGP40121 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPGP40121 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPGP40121 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPGP40121 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPGP40121 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPGP40121 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPGP40121 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPGP40121 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPGP40121 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPGP40121 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPGP40121 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPGP40121 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPGP40121 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPGP40121 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPGP40121 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPGP40121 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPGP40121 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPGP40121 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPGP40121 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPGP40121 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPGP40121 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPGP40121 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPGP40121 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPGP40121 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPGP40121 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPGP40121 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPGP40121 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPGP40121 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPGP40121 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPGP40121 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPGP40121 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPGP40121 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPGP40121 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPGP40121 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPGP40121 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPGP40121 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPGP40121 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPGP40121 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPGP40121 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPGP40121 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPGP40121 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPGP40121 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPGP40121 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPGP40121 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPGP40121 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPGP40121 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPGP40121 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPGP40121 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPGP40121 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPGP40121 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPGP40121 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPGP40121 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPGP40121 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPGP40121 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPGP40121 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPGP40121 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPGP40121 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPGP40121 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPGP40121 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPGP40121 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms