Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FEN1P39748 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FEN1P39748 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FEN1P39748 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FEN1P39748 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FEN1P39748 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FEN1P39748 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FEN1P39748 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FEN1P39748 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FEN1P39748 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FEN1P39748 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FEN1P39748 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FEN1P39748 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FEN1P39748 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FEN1P39748 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FEN1P39748 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FEN1P39748 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FEN1P39748 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FEN1P39748 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FEN1P39748 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FEN1P39748 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FEN1P39748 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FEN1P39748 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FEN1P39748 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FEN1P39748 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FEN1P39748 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FEN1P39748 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FEN1P39748 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FEN1P39748 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FEN1P39748 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FEN1P39748 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FEN1P39748 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FEN1P39748 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FEN1P39748 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FEN1P39748 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FEN1P39748 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FEN1P39748 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FEN1P39748 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FEN1P39748 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FEN1P39748 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FEN1P39748 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FEN1P39748 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FEN1P39748 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FEN1P39748 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FEN1P39748 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FEN1P39748 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FEN1P39748 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FEN1P39748 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FEN1P39748 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FEN1P39748 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FEN1P39748 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FEN1P39748 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FEN1P39748 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FEN1P39748 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FEN1P39748 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FEN1P39748 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FEN1P39748 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FEN1P39748 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FEN1P39748 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FEN1P39748 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FEN1P39748 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FEN1P39748 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FEN1P39748 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FEN1P39748 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FEN1P39748 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FEN1P39748 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FEN1P39748 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FEN1P39748 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FEN1P39748 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FEN1P39748 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FEN1P39748 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FEN1P39748 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms