Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 QRI5YLR204W 336 nt4.68□□□□□ -1.66
AVT5P38176 YML018CYML018C 1182 nt4.68□□□□□ -1.66
AVT5P38176 RNH201YNL072W 924 nt4.68□□□□□ -1.66
AVT5P38176 snR34snR34 203 nt4.68□□□□□ -1.66
AVT5P38176 HOS1YPR068C 1413 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 Q0144Q0144 330 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 RPS5YJR123W 678 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 SFK1YKL051W 1062 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 YLR463CYLR463C 552 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 SPC24YMR117C 642 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 MTF1YMR228W 1026 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 YTA6YPL074W 2265 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 RBA50YDR527W 1320 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 ISR1YPR106W 1332 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 UGO1YDR470C 1509 nt4.67□□□□□ -1.66
AVT5P38176 HXT3YDR345C 1704 nt4.66□□□□□ -1.66
AVT5P38176 DJP1YIR004W 1299 nt4.66□□□□□ -1.66
AVT5P38176 MPM1YJL066C 759 nt4.66□□□□□ -1.66
AVT5P38176 MTW1YAL034W-A 870 nt4.66□□□□□ -1.66
AVT5P38176 snR10snR10 245 nt4.66□□□□□ -1.66
AVT5P38176 GPI18YBR004C 1302 nt4.66□□□□□ -1.66
AVT5P38176 NUP1YOR098C 3231 nt4.66□□□□□ -1.66
AVT5P38176 PAL1YDR348C 1500 nt4.66□□□□□ -1.66
AVT5P38176 PRI2YKL045W 1587 nt4.65□□□□□ -1.66
AVT5P38176 HXT5YHR096C 1779 nt4.65□□□□□ -1.66
AVT5P38176 ADE6YGR061C 4077 nt4.65□□□□□ -1.66
AVT5P38176 RPR2YIR015W 435 nt4.65□□□□□ -1.67
AVT5P38176 RRT7YLL030C 342 nt4.65□□□□□ -1.67
AVT5P38176 PML1YLR016C 615 nt4.65□□□□□ -1.67
AVT5P38176 ALG5YPL227C 1005 nt4.65□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt4.65□□□□□ -1.67
AVT5P38176 ASK10YGR097W 3441 nt4.65□□□□□ -1.67
AVT5P38176 FOL1YNL256W 2475 nt4.65□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YDR109CYDR109C 2148 nt4.64□□□□□ -1.67
AVT5P38176 NSI1YDR026C 1713 nt4.64□□□□□ -1.67
AVT5P38176 IPK1YDR315C 846 nt4.64□□□□□ -1.67
AVT5P38176 CDC43YGL155W 1131 nt4.64□□□□□ -1.67
AVT5P38176 ZRT1YGL255W 1131 nt4.64□□□□□ -1.67
AVT5P38176 CIN4YMR138W 576 nt4.64□□□□□ -1.67
AVT5P38176 MRPS5YBR251W 924 nt4.64□□□□□ -1.67
AVT5P38176 MET7YOR241W 1647 nt4.64□□□□□ -1.67
AVT5P38176 APE3YBR286W 1614 nt4.64□□□□□ -1.67
AVT5P38176 TDA7YNL176C 1911 nt4.64□□□□□ -1.67
AVT5P38176 WHI4YDL224C 1950 nt4.64□□□□□ -1.67
AVT5P38176 SLT2YHR030C 1455 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 DAK1YML070W 1755 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 SKS1YPL026C 1509 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 PEX19YDL065C 1029 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 SEC20YDR498C 1152 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 VAM7YGL212W 951 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YAR061WYAR061W 204 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 DCI1YOR180C 816 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 FOB1YDR110W 1701 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 SMF3YLR034C 1422 nt4.63□□□□□ -1.67
AVT5P38176 HFI1YPL254W 1467 nt4.62□□□□□ -1.67
AVT5P38176 CAF4YKR036C 1932 nt4.62□□□□□ -1.67
AVT5P38176 CLF1YLR117C 2064 nt4.62□□□□□ -1.67
AVT5P38176 REX3YLR107W 1215 nt4.62□□□□□ -1.67
AVT5P38176 UBC11YOR339C 471 nt4.62□□□□□ -1.67
AVT5P38176 CSG2YBR036C 1233 nt4.62□□□□□ -1.67
AVT5P38176 MLC2YPR188C 492 nt4.62□□□□□ -1.67
AVT5P38176 FES1YBR101C 873 nt4.62□□□□□ -1.67
AVT5P38176 VNX1YNL321W 2727 nt4.62□□□□□ -1.67
AVT5P38176 MUM3YOR298W 1440 nt4.62□□□□□ -1.67
AVT5P38176 STE7YDL159W 1548 nt4.62□□□□□ -1.67
AVT5P38176 SEC39YLR440C 2130 nt4.61□□□□□ -1.67
AVT5P38176 TRK2YKR050W 2670 nt4.61□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YCR006CYCR006C 474 nt4.61□□□□□ -1.67
AVT5P38176 DOT5YIL010W 648 nt4.61□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YIR043CYIR043C 693 nt4.61□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YKR075CYKR075C 924 nt4.61□□□□□ -1.67
AVT5P38176 MSA2YKR077W 1092 nt4.61□□□□□ -1.67
AVT5P38176 POS5YPL188W 1245 nt4.61□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YML082WYML082W 1950 nt4.61□□□□□ -1.67
AVT5P38176 FHL1YPR104C 2811 nt4.61□□□□□ -1.67
AVT5P38176 SIF2YBR103W 1608 nt4.61□□□□□ -1.67
AVT5P38176 SPC97YHR172W 2472 nt4.6□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YCR099CYCR099C 468 nt4.6□□□□□ -1.67
AVT5P38176 RAM1YDL090C 1296 nt4.6□□□□□ -1.67
AVT5P38176 FYV1YDR024W 486 nt4.6□□□□□ -1.67
AVT5P38176 HST4YDR191W 1113 nt4.6□□□□□ -1.67
AVT5P38176 NPY1YGL067W 1155 nt4.6□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YBL044WYBL044W 369 nt4.6□□□□□ -1.67
AVT5P38176 MTQ1YNL063W 945 nt4.6□□□□□ -1.67
AVT5P38176 ADE12YNL220W 1302 nt4.6□□□□□ -1.67
AVT5P38176 MCH4YOL119C 1506 nt4.6□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YGR125WYGR125W 3111 nt4.59□□□□□ -1.67
AVT5P38176 LUC7YDL087C 786 nt4.59□□□□□ -1.67
AVT5P38176 ATO3YDR384C 828 nt4.59□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YER010CYER010C 705 nt4.59□□□□□ -1.67
AVT5P38176 EDC1YGL222C 528 nt4.59□□□□□ -1.67
AVT5P38176 MMP1YLL061W 1752 nt4.59□□□□□ -1.67
AVT5P38176 MMR1YLR190W 1476 nt4.59□□□□□ -1.67
AVT5P38176 YML101C-AYML101C-A 318 nt4.59□□□□□ -1.67
AVT5P38176 TIF34YMR146C 1044 nt4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.3 ms