Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ZEB1P37275 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms