Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FDFT1P37268 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FDFT1P37268 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms