Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2IP36954 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2IP36954 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2IP36954 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2IP36954 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2IP36954 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2IP36954 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2IP36954 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2IP36954 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2IP36954 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2IP36954 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2IP36954 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2IP36954 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2IP36954 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2IP36954 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2IP36954 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2IP36954 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2IP36954 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2IP36954 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2IP36954 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2IP36954 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2IP36954 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2IP36954 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2IP36954 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2IP36954 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2IP36954 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2IP36954 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2IP36954 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2IP36954 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2IP36954 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2IP36954 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms