Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RORAP35398 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RORAP35398 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RORAP35398 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RORAP35398 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RORAP35398 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RORAP35398 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RORAP35398 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RORAP35398 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RORAP35398 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RORAP35398 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RORAP35398 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RORAP35398 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RORAP35398 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RORAP35398 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RORAP35398 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORAP35398 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORAP35398 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORAP35398 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORAP35398 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RORAP35398 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORAP35398 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORAP35398 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RORAP35398 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORAP35398 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RORAP35398 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORAP35398 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORAP35398 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORAP35398 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORAP35398 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORAP35398 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORAP35398 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORAP35398 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORAP35398 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORAP35398 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORAP35398 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORAP35398 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORAP35398 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORAP35398 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RORAP35398 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORAP35398 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORAP35398 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORAP35398 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORAP35398 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORAP35398 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RORAP35398 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORAP35398 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RORAP35398 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RORAP35398 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RORAP35398 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RORAP35398 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RORAP35398 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RORAP35398 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RORAP35398 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORAP35398 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORAP35398 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORAP35398 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORAP35398 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORAP35398 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORAP35398 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORAP35398 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORAP35398 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORAP35398 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORAP35398 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORAP35398 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORAP35398 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORAP35398 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORAP35398 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RORAP35398 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORAP35398 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORAP35398 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORAP35398 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORAP35398 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORAP35398 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORAP35398 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RORAP35398 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms