Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RYKP34925 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RYKP34925 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RYKP34925 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RYKP34925 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RYKP34925 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RYKP34925 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RYKP34925 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RYKP34925 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RYKP34925 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RYKP34925 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RYKP34925 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RYKP34925 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RYKP34925 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RYKP34925 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RYKP34925 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RYKP34925 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RYKP34925 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RYKP34925 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RYKP34925 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RYKP34925 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RYKP34925 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RYKP34925 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RYKP34925 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RYKP34925 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RYKP34925 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RYKP34925 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RYKP34925 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RYKP34925 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RYKP34925 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RYKP34925 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RYKP34925 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RYKP34925 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RYKP34925 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RYKP34925 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RYKP34925 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RYKP34925 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RYKP34925 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RYKP34925 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RYKP34925 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RYKP34925 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RYKP34925 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RYKP34925 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RYKP34925 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RYKP34925 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RYKP34925 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RYKP34925 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RYKP34925 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RYKP34925 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RYKP34925 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RYKP34925 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RYKP34925 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RYKP34925 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RYKP34925 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RYKP34925 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RYKP34925 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RYKP34925 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RYKP34925 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RYKP34925 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RYKP34925 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RYKP34925 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RYKP34925 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RYKP34925 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RYKP34925 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RYKP34925 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RYKP34925 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RYKP34925 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RYKP34925 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RYKP34925 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RYKP34925 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RYKP34925 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RYKP34925 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RYKP34925 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RYKP34925 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RYKP34925 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RYKP34925 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RYKP34925 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RYKP34925 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RYKP34925 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RYKP34925 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RYKP34925 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RYKP34925 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms