Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASQ1P31415 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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