Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA5P30532 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA5P30532 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms