Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TM4SF1P30408 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TM4SF1P30408 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms