Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK1P30085 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK1P30085 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms