Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB2P29033 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJB2P29033 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJB2P29033 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJB2P29033 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJB2P29033 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJB2P29033 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB2P29033 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB2P29033 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB2P29033 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB2P29033 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB2P29033 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB2P29033 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB2P29033 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB2P29033 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB2P29033 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB2P29033 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB2P29033 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB2P29033 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB2P29033 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB2P29033 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB2P29033 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB2P29033 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB2P29033 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB2P29033 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB2P29033 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB2P29033 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB2P29033 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB2P29033 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB2P29033 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJB2P29033 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GJB2P29033 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB2P29033 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB2P29033 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB2P29033 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB2P29033 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB2P29033 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB2P29033 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB2P29033 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB2P29033 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB2P29033 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB2P29033 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB2P29033 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB2P29033 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB2P29033 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB2P29033 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB2P29033 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB2P29033 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB2P29033 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB2P29033 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB2P29033 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB2P29033 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB2P29033 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB2P29033 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB2P29033 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB2P29033 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB2P29033 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB2P29033 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB2P29033 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB2P29033 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB2P29033 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB2P29033 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB2P29033 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB2P29033 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB2P29033 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB2P29033 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB2P29033 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB2P29033 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB2P29033 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB2P29033 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB2P29033 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB2P29033 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB2P29033 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB2P29033 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB2P29033 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB2P29033 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB2P29033 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB2P29033 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB2P29033 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB2P29033 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB2P29033 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB2P29033 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB2P29033 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB2P29033 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB2P29033 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB2P29033 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB2P29033 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB2P29033 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms