Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF8P28908 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFRSF8P28908 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms