Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD34P28906 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD34P28906 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD34P28906 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD34P28906 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD34P28906 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD34P28906 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD34P28906 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD34P28906 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD34P28906 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD34P28906 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CD34P28906 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD34P28906 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD34P28906 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD34P28906 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD34P28906 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD34P28906 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD34P28906 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD34P28906 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD34P28906 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD34P28906 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD34P28906 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD34P28906 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD34P28906 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD34P28906 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD34P28906 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD34P28906 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD34P28906 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD34P28906 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD34P28906 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD34P28906 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD34P28906 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD34P28906 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD34P28906 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CD34P28906 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD34P28906 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CD34P28906 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD34P28906 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD34P28906 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD34P28906 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD34P28906 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD34P28906 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD34P28906 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD34P28906 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CD34P28906 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD34P28906 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CD34P28906 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD34P28906 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD34P28906 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD34P28906 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD34P28906 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD34P28906 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CD34P28906 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD34P28906 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD34P28906 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD34P28906 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD34P28906 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD34P28906 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CD34P28906 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD34P28906 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD34P28906 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD34P28906 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD34P28906 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CD34P28906 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD34P28906 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD34P28906 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD34P28906 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CD34P28906 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD34P28906 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD34P28906 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms